MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98 plasmid pT181

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013452	ATA	2	6	126	131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225768
2	NC_013452	ACTT	2	8	164	171	25 %	50 %	0 %	25 %	262225768
3	NC_013452	TAA	2	6	193	198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225768
4	NC_013452	TAA	2	6	208	213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225768
5	NC_013452	TTGA	2	8	215	222	25 %	50 %	25 %	0 %	262225768
6	NC_013452	A	6	6	225	230	100 %	0 %	0 %	0 %	262225768
7	NC_013452	AGA	2	6	334	339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225768
8	NC_013452	T	6	6	350	355	0 %	100 %	0 %	0 %	262225768
9	NC_013452	TAT	2	6	402	407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225768
10	NC_013452	A	6	6	429	434	100 %	0 %	0 %	0 %	262225768
11	NC_013452	CAC	2	6	435	440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262225768
12	NC_013452	GTT	2	6	455	460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262225768
13	NC_013452	TGA	2	6	469	474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225768
14	NC_013452	AAG	2	6	492	497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225768
15	NC_013452	TAA	2	6	505	510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225768
16	NC_013452	A	6	6	509	514	100 %	0 %	0 %	0 %	262225768
17	NC_013452	AGAT	2	8	532	539	50 %	25 %	25 %	0 %	262225768
18	NC_013452	AAC	2	6	555	560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262225768
19	NC_013452	A	6	6	636	641	100 %	0 %	0 %	0 %	262225768
20	NC_013452	A	6	6	678	683	100 %	0 %	0 %	0 %	262225768
21	NC_013452	GGT	2	6	794	799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262225768
22	NC_013452	TGT	2	6	832	837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262225768
23	NC_013452	GCT	2	6	881	886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262225768
24	NC_013452	TA	3	6	911	916	50 %	50 %	0 %	0 %	262225768
25	NC_013452	GAT	2	6	935	940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225768
26	NC_013452	GA	3	6	957	962	50 %	0 %	50 %	0 %	262225768
27	NC_013452	GAT	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225768
28	NC_013452	TTA	2	6	971	976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225768
29	NC_013452	GAA	2	6	1116	1121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225768
30	NC_013452	TAA	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225768
31	NC_013452	AGA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225768
32	NC_013452	A	7	7	1196	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	262225768
33	NC_013452	GAACAG	2	12	1223	1234	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	262225768
34	NC_013452	CAA	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262225768
35	NC_013452	AAC	2	6	1242	1247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262225768
36	NC_013452	TTGG	2	8	1313	1320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013452	GTTG	2	8	1353	1360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013452	CAA	2	6	1398	1403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013452	GAA	2	6	1465	1470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013452	AAGT	2	8	1506	1513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013452	TAG	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013452	ATA	2	6	1552	1557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013452	TAAA	2	8	1566	1573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013452	A	7	7	1571	1577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013452	TAA	2	6	1619	1624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013452	CAT	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013452	A	7	7	1684	1690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013452	GTT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013452	AT	4	8	1754	1761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013452	T	6	6	1806	1811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013452	TG	3	6	1916	1921	0 %	50 %	50 %	0 %	262225769
52	NC_013452	TTC	2	6	2041	2046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262225769
53	NC_013452	TAAAGC	2	12	2057	2068	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	262225769
54	NC_013452	CAAA	2	8	2152	2159	75 %	0 %	0 %	25 %	262225769
55	NC_013452	ATA	2	6	2196	2201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225769
56	NC_013452	AGATT	2	10	2229	2238	40 %	40 %	20 %	0 %	262225769
57	NC_013452	GAT	2	6	2256	2261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225769
58	NC_013452	ACT	2	6	2269	2274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262225769
59	NC_013452	T	6	6	2308	2313	0 %	100 %	0 %	0 %	262225769
60	NC_013452	GA	3	6	2354	2359	50 %	0 %	50 %	0 %	262225769
61	NC_013452	TTA	2	6	2371	2376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225769
62	NC_013452	TAA	2	6	2384	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225769
63	NC_013452	TGG	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262225769
64	NC_013452	TGA	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225769
65	NC_013452	AGA	2	6	2585	2590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225769
66	NC_013452	CGAA	2	8	2692	2699	50 %	0 %	25 %	25 %	262225769
67	NC_013452	ATATTA	2	12	2762	2773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013452	AT	3	6	2787	2792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013452	AGG	2	6	2810	2815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013452	T	7	7	2817	2823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013452	AAT	2	6	2870	2875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013452	GTTTA	2	10	2920	2929	20 %	60 %	20 %	0 %	262225770
73	NC_013452	TA	3	6	2928	2933	50 %	50 %	0 %	0 %	262225770
74	NC_013452	A	6	6	2933	2938	100 %	0 %	0 %	0 %	262225770
75	NC_013452	GTTT	2	8	2946	2953	0 %	75 %	25 %	0 %	262225770
76	NC_013452	T	6	6	2987	2992	0 %	100 %	0 %	0 %	262225770
77	NC_013452	AAATG	2	10	3001	3010	60 %	20 %	20 %	0 %	262225770
78	NC_013452	TAC	2	6	3052	3057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262225770
79	NC_013452	AT	3	6	3088	3093	50 %	50 %	0 %	0 %	262225770
80	NC_013452	CAG	2	6	3114	3119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262225770
81	NC_013452	TA	3	6	3140	3145	50 %	50 %	0 %	0 %	262225770
82	NC_013452	A	7	7	3151	3157	100 %	0 %	0 %	0 %	262225770
83	NC_013452	ATT	2	6	3164	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
84	NC_013452	ATTG	2	8	3196	3203	25 %	50 %	25 %	0 %	262225770
85	NC_013452	T	6	6	3224	3229	0 %	100 %	0 %	0 %	262225770
86	NC_013452	CTG	2	6	3267	3272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262225770
87	NC_013452	TGG	2	6	3291	3296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262225770
88	NC_013452	A	7	7	3319	3325	100 %	0 %	0 %	0 %	262225770
89	NC_013452	AAT	2	6	3397	3402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262225770
90	NC_013452	TTA	2	6	3471	3476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
91	NC_013452	CAA	2	6	3498	3503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262225770
92	NC_013452	A	6	6	3502	3507	100 %	0 %	0 %	0 %	262225770
93	NC_013452	TAT	2	6	3547	3552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
94	NC_013452	T	6	6	3589	3594	0 %	100 %	0 %	0 %	262225770
95	NC_013452	T	6	6	3611	3616	0 %	100 %	0 %	0 %	262225770
96	NC_013452	TTA	2	6	3624	3629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
97	NC_013452	TTA	2	6	3657	3662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
98	NC_013452	GTTT	2	8	3699	3706	0 %	75 %	25 %	0 %	262225770
99	NC_013452	TGG	2	6	3709	3714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262225770
100	NC_013452	TAG	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225770
101	NC_013452	ATG	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225770
102	NC_013452	TGG	2	6	3853	3858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262225770
103	NC_013452	T	6	6	3859	3864	0 %	100 %	0 %	0 %	262225770
104	NC_013452	ATT	2	6	3883	3888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
105	NC_013452	TTTTA	2	10	3892	3901	20 %	80 %	0 %	0 %	262225770
106	NC_013452	T	6	6	3925	3930	0 %	100 %	0 %	0 %	262225770
107	NC_013452	T	6	6	3941	3946	0 %	100 %	0 %	0 %	262225770
108	NC_013452	ACT	2	6	3968	3973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262225770
109	NC_013452	AGT	2	6	4040	4045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225770
110	NC_013452	GAA	3	9	4052	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225770
111	NC_013452	T	6	6	4096	4101	0 %	100 %	0 %	0 %	262225770
112	NC_013452	AGG	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262225770
113	NC_013452	ATT	2	6	4185	4190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
114	NC_013452	TTA	2	6	4233	4238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
115	NC_013452	TGT	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262225770
116	NC_013452	ATT	2	6	4259	4264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225770
117	NC_013452	TTATA	2	10	4298	4307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013452	T	6	6	4349	4354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.